Действие фантастического триллера «Призрак в доспехах» происходит в недалеком будущем, когда жизнь людей определяется кибертехнологиями, а «нейронные имплантаты», вживленные в мозг, стали обычным делом. Единственный в своем роде гибрид человека и киборга, Майор (Скарлетт Йоханссон) работает на элитное подразделение Бюро Общественной безопасности, известное как «Девятый отдел» и возглавляемое Дайсукэ Арамаки (Такеши Китано). По поручению компании Hanka Robotics она должна вычислить террористов, действующих под руководством хитроумного хакера по прозвищу Кукловод (Майкл Питт), который обнаружил уязвимость нанотехнологии, что позволило ему «взламывать» сознание обычных людей.