События в картине «Мозг Гиммлера зовется Гейдрихом» развиваются в 1930-х годах. Вернувшись со службы в военно-морских силах Германии, Райнхард Гейдрих (Джейсон Кларк) вместе со своей женой Линой (Розамунд Пайк) вступает в партию национал-социалистов и вскоре становится правой рукой лидера Гестапо, Генриха Гиммлера. С тех пор Гейдрих известен как один из самых опасных деятелей нацистского режима. В 1942 году, когда он находится в Чехословакии во время немецкой оккупации, Сопротивление разрабатывает план убийства Гейдриха, исполнить который должны два молодых солдата — Йозеф Габчик (Джек Рейнор) и Ян Кубиш (Джек О’Коннелл). Пройдя обучение в Лондоне, агенты прибывают в Прагу, где Ян влюбляется в Анну Новак (Миа Васиковска) и где должно произойти роковое покушение.