Мальчик Льюис Барнавелт (Оуэн Ваккаро) потерял родителей и теперь вынужден переехать к своему дяде Джонатану (Джек Блэк). Переступив порог старинного особняка, юноша окунается в странный мир волшебства, где повсюду тикают часы, а за каждой дверью кроется тайна. Вскоре Льюис узнает, что его дядя настоящий волшебник, а в сердце дома хранятся старинные часы, собранные черным магом Айзеком Изардом (Кайл МакЛахлан). С их помощью тот хотел повелевать временем, но скончался так и завершив свою работу. Вдова Изарда по имени Селена (Рене Элис Голдсберри) решает найти эти часы, поэтому Льюис, Джонатан и их соседка ведьма миссис Зиммерман (Кейт Бланшетт) должны сделать это первыми.