События Star Driver происходят на выдуманном острове Южного креста. Однажды ночью на берег острова вынесло мальчика по имени Такуто. Он поступает в Старшую школу Южного креста, где заводит новых друзей. В то же время в школе существует группа таинственных гигантов, называемых Кибоди, которыми могут управлять люди в альтернативном измерении — нулевом времени. Такуто ввязывается в противостояние с «Glittering Crux Brigade», таинственной группой, желающей взять контроль на островными Кибоди для достижения своих целей.